首都医科大学是全国最早开展生物医学工程专业教育与研究的学校之一。年开始生物医学工程专业教育，年成立生物医学工程学系，并于年成立了生物医学工程学院，目前是教育部生物医学工程专业教学指导委员会委员单位。

依托首都医科大学具有临床医学特色的国家生命科学人才培养基地和丰富的医学资源，生物医学工程学院按照“理工科学与生物医学紧密结合，基础研究与临床实际紧密结合”的学科发展理念，遵循“依据生物学等理学原理，利用工程学技术，与医学工作者合作解决医学实际中的问题”的工作思路，立足北京，面向行业，努力打造“临床工程”和“康复工程”特色突出的生物医学工程学科。

学院有生物医学工程、听力与言语康复学和假肢矫形工程三个本科专业。生物医学工程专业是国家一流本科专业建设点，是首批国家级和北京市级特色专业。生物医学工程专业教育开办时间早，医学特色突出，在国内享有良好声望。年学校生物医学工程专业开设听力学专业方向，年开办“听力与言语康复学”专业。假肢矫形工程专业是省部级一流本科专业建设点，是北京市特色专业。年通过国际假肢/矫形器师教育资质一级认证。学院拥有生物医学工程一级学科博士学位授权点，生物医学工程博士后流动站，工程(电子信息技术)硕士学位授权点，实现了从本科到研究生各层次人才培养。

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